Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. CA Desktop DNA Migrator unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von CA Desktop DNA Migrator unterstützten Basisdateien sind .DNA. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in CA Desktop DNA Migrator zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von CA Desktop DNA Migrator verwendet werden.
Mit CA Desktop DNA Migrator können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über CA Desktop DNA Migrator öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von CA Desktop DNA Migrator unterstützten Dateiformat zu speichern.