Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. BZFlag unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von BZFlag unterstützten Basisdateien sind .BZW. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in BZFlag zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von BZFlag verwendet werden.
Mit BZFlag können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über BZFlag öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von BZFlag unterstützten Dateiformat zu speichern.