Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. BrainLED AlfaWave unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von BrainLED AlfaWave unterstützten Basisdateien sind .BAW. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in BrainLED AlfaWave zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von BrainLED AlfaWave verwendet werden.
Mit BrainLED AlfaWave können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über BrainLED AlfaWave öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von BrainLED AlfaWave unterstützten Dateiformat zu speichern.