Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Box Sync unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Box Sync unterstützten Basisdateien sind .WEBDOC. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Box Sync zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Box Sync verwendet werden.
Mit Box Sync können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Box Sync öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Box Sync unterstützten Dateiformat zu speichern.