Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. BestCrypt unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von BestCrypt unterstützten Basisdateien sind .KBB. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in BestCrypt zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von BestCrypt verwendet werden.
Mit BestCrypt können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über BestCrypt öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von BestCrypt unterstützten Dateiformat zu speichern.