Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. BBEdit unterstützt mindestens 26 verschiedene Dateiendungen. Die von BBEdit unterstützten Basisdateien sind .XSD. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in BBEdit zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von BBEdit verwendet werden.
Mit BBEdit können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über BBEdit öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von BBEdit unterstützten Dateiformat zu speichern.