Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Bamboo Paper for Desktop unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Bamboo Paper for Desktop unterstützten Basisdateien sind .BAMBOOPAPER. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Bamboo Paper for Desktop zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Bamboo Paper for Desktop verwendet werden.
Mit Bamboo Paper for Desktop können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Bamboo Paper for Desktop öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Bamboo Paper for Desktop unterstützten Dateiformat zu speichern.