Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. AutoFlix unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von AutoFlix unterstützten Basisdateien sind .MVF. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in AutoFlix zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von AutoFlix verwendet werden.
Mit AutoFlix können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über AutoFlix öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von AutoFlix unterstützten Dateiformat zu speichern.