Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Atomic Mail Sender unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von Atomic Mail Sender unterstützten Basisdateien sind .AMSM. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Atomic Mail Sender zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Atomic Mail Sender verwendet werden.
Mit Atomic Mail Sender können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Atomic Mail Sender öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Atomic Mail Sender unterstützten Dateiformat zu speichern.