Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Atlast File Notes Organizer unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Atlast File Notes Organizer unterstützten Basisdateien sind .FNO. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Atlast File Notes Organizer zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Atlast File Notes Organizer verwendet werden.
Mit Atlast File Notes Organizer können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Atlast File Notes Organizer öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Atlast File Notes Organizer unterstützten Dateiformat zu speichern.