Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. ARJ32 unterstützt mindestens 24 verschiedene Dateiendungen. Die von ARJ32 unterstützten Basisdateien sind .ARJ. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in ARJ32 zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von ARJ32 verwendet werden.
Mit ARJ32 können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über ARJ32 öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von ARJ32 unterstützten Dateiformat zu speichern.