Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Apple Project Builder unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Apple Project Builder unterstützten Basisdateien sind .PBPROJ. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Apple Project Builder zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Apple Project Builder verwendet werden.
Mit Apple Project Builder können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Apple Project Builder öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Apple Project Builder unterstützten Dateiformat zu speichern.