Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Apex Medina unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Apex Medina unterstützten Basisdateien sind .AX3. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Apex Medina zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Apex Medina verwendet werden.
Mit Apex Medina können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Apex Medina öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Apex Medina unterstützten Dateiformat zu speichern.