Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. 3DVIA Virtools unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von 3DVIA Virtools unterstützten Basisdateien sind .NMO. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in 3DVIA Virtools zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von 3DVIA Virtools verwendet werden.
Mit 3DVIA Virtools können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über 3DVIA Virtools öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von 3DVIA Virtools unterstützten Dateiformat zu speichern.