Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. 3D-Tool unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von 3D-Tool unterstützten Basisdateien sind .XGL. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in 3D-Tool zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von 3D-Tool verwendet werden.
Mit 3D-Tool können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über 3D-Tool öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von 3D-Tool unterstützten Dateiformat zu speichern.